O mais secreto departamento do Ministério da Magia, é possivelmente o departamento com mais subordinados dentro do ministério. Os bruxos que ali trabalham se dedicam a estudar os assuntos mais obscuros e poderosos do mundo bruxo, tais como a morte, passado e futuro, e são chamados de Inomináveis, já que ninguém sabe o que fazem ali dentro.
Fruto de pesquisas dessa seção ministerial, o Departamento de Mistérios, no ano de 1672, demonstrou que os bruxos e bruxas nascem feitos.